然而,由于有着相对较高的错误率,现存的测序技术很难确定一段序列的变异究竟代表着新菌种的存在,抑或只是由于测序错误。所幸,耶利米•费斯(Jeremiah J. Faith)和同事们开发出一种被称为“低错扩增子测序”(LEA-Seq)的新型测序技术。LEA-Seq 技术采用“以数量换取质量”的策略,通过标记特定的DNA片段,并利用聚合酶链式反应(PCR)扩增这些目标序列,最终使得同一段目标序列能被测序多次,从而提高测序结果的准确率(见下图)。
利用 LEA-Seq技术对多种细菌中编码16S rRNA 的基因(16S rDNA)进行测序。首先对细菌 16S rDNA进行线性的PCR扩增,得到具有标签的目标序列,再以其为模板进行指数扩增并测序,使得一段目标序列有多个测序结果,使测序准确率更高。来源:J.J. Faith et al.